元エリート操縦士（パイロット）だった父の英才教育を受け、どんな事故（アクシデント）にも対応できる世界一の機長（キャプテン）を目指す長谷川ありす（26歳）。事故に遭う飛行機を予知できるという少年・慧（けい）に出会ったことから、事故予知機に搭乗して無事フライトを遂行させるプロジェクト“チーム・守護神（ガーディアン）”の一員に抜擢されて……!?　主人公は女性パイロット。操縦技術に天賦の才あり。パイロット適性に少々難あり。極限の状況下、彼女は歓喜の笑みをこぼす――。高田裕三が描く新たなヒロイン、ここに始動!

慧（けい）の予言通りに、飛行機は離陸直前にアクシデントが発生。バードストライクによる左エンジンからの出火!　乗客の避難が進められていくが、脱出用の扉を開けたその時、機内に有毒ガスが充満してしまう!!　飛行機に乗り込んでいた長谷川ありすは、迷うことなくコックピットへ向かい、煙を排出させようとするが……!?

謹慎中のありすがオブザーバーとして搭乗した旅客機JA907X・503便は、修学旅行の中学生たちを乗せ日本を発った。だが目的地のホーチミンへ向かう途中にハイジャックが発生!　なんと、犯人は乗っている中学生280人全員――!!　ハイテク機の心臓部であるMEC（電子機器室）に爆弾を仕掛け、目的地の変更を求める彼らの本当の要求とは……!?　そしてさらなるアクシデントがありすたちを襲う!!

「貴機を撃墜する」それはかつてない極限――。乗客520名を乗せ、成田行きASJ024便はパリのシャルル・ド・ゴール空港を無事離陸。2時間後――ロシア領空内にて、戦闘機ミグ25に遭遇。ロシア空軍から「ミグ25のパイロットはテロリスト」との無線を受信する。無理に引き離そうとすれば撃墜は必至。一瞬の判断ミスが520人の命取りに。アリス達クルーの使命はただ一つ。最善の選択を見極める事!!

アメリカ第7艦隊空母にミグを着艦させるため、インド洋へ向かうASJ024。無事にインド領空を抜け、目指すアメリカ空母まであと少し。だが、アリスたちの背後に突然現れたロシア空軍のステルス戦闘機が迫る――!!　ジャンボジェット機vs.最新鋭戦闘機！　勝算という言葉すら、口に出すのもはばかられる撃墜必至の変則ドッグファイト。勝るものがあるとすれば、唯一つ。「心のスペック」!!　守るべき人を守るため、操縦桿はアリスに託される――。