剣の達人・一樹は召喚魔法を総べる神魔から謎痕＜エニグマ＞を授けられ、国立騎士学院の魔技科への進学を余儀なくされる。一方、一樹の妹で剣技科の生徒会長を務める鼎は、一樹の魔技科進学が不服で……？　対抗する二つの生徒会の狭間に立つ一樹が、剣と魔法をデュアルに繰るスクールバトル・コロシアム、いま開幕――!!

ロキ戦以降、一樹と美桜は二人きりで学外クエストに臨んでいた。そんなとき転入生ロッテがやってくる。しかし謎痕＜エニグマ＞が進路を定めるこの国で、魔技科への転入生などあり得ない。さらにリズリサの命で一樹たちが秘密を抱くロッテを迎えてから、一樹たちを不穏な空気が襲いはじめる――!　剣×魔の絶技、第二弾!!

消えた兄・一樹を捜索する鼎が“風神子猫”の威信をかけて琥珀と激突!!　一方、レメと学院のすべてを繋ぎ止めると決意した一樹を、新たに出現した未知の聖痕魔法使い“クアッドコア・マギカ”が襲撃する！　剣×魔の絶技、激闘総力戦!!

魔技科・剣技科を統べる「総生徒会長」統一戦挙開幕！　投票前に生徒に示す“闘約”として候補者が編成するチーム対抗の模擬戦が催されるが、一樹や輝夜、光のほか、キナ臭い候補者が出馬し――!?　剣・魔、激闘！

総生徒会長統一戦挙、決勝の前に敗者復活式の3位決定戦が開催された。輝夜と光の因縁の対決に湧く学園。続く一樹は疑惑の相手と命懸けの決勝に臨む！　熾烈極める剣魔の激突、決勝戦！――そして。東西戦、勃発!!