中学に入学したばかりの僕・藤白圭一郎に、
毎日声をかけてくる不思議な３年生、紅月翼先輩。
学校一の人気者が、僕になんの用があるっていうんだろう。
とりあえず、あまり気をゆるさないほうが良さそうだ。
ところがそんなとき、僕は、クラスメイトの無くしたアクセサリーから
やっかいなトラブルのにおいを嗅ぎとってしまう。
友達を守るため、ひとり解決の道を探ろうとしていると
翼先輩が「俺を巻き込めよ。勇気と無謀は違うぞ」と言いだして…。
「僕の計算では、勝算はわずか20％です。それでも手伝ってくれると？」
「あたりまえだ。そんな確率は、この俺が100％にしてやる」

ここに、新たなチームの歴史が始まる――その名も、怪盗レッド！

生き別れだった兄の翼、妹の美華子と再会した、圭一郎。
これまで自分は、ごくふつうの父子家庭に育ったと思っていたけど…
じつは、圭一郎が生まれた「紅月家」は、代々「義賊」の家系で、
一族の子どもは「13歳になると活動をはじめる宿命」にあるという。
翼、美華子といっしょに、成り行きで
一度は〈怪盗レッド〉を名乗ったけれど…
「しらない他人のために、命をかける――？　そんなこと僕にはできません」
〈戦う理由〉をめぐって、兄妹との対立が…!?

本格稼働する兄妹怪盗チーム・怪盗レッド。
その真の敵とは――自分たちの絆!?