この世の生者に害をなす荒魂を狩りだし、死の国である常世（とこよ）に送る夜叉鴉の活躍を描いたアクションファンタジー！　強い怒りや悲しみ、怨みを持つ死者の魂が放置されて現世に留まれば、それはこの世に害をなす恐ろしい荒魂と化す。熊野真宮の宮司を務めるノーテンキな青年・那智武流（なち・たける）は、八咫鏡が鳴り響く時、邪悪な荒魂を狩り出す熊野闇検校・夜叉鴉になって天空を舞う!!

女子中高生を撮らせたら最高だと評判のカメラマン・野島光司（のじま・こうじ）。しかし、彼に撮影された少女達は皆、人が変わったかのように無気力になっていた。呪われたカメラのお祓いを依頼された熊野真宮の宮司・那智武流（なち・たける）は、そのカメラの持ち主となった野島を追って、彼のモデルになる予定の少女・敦子（あつこ）の元に赴く。

荒魂化した薬丸怪市（やくまる・かいいち）にガードを依頼された影忍一族の幽蝸みづは（ゆら・みづは）は、巫女の勢伊子（せいこ）を人質に取り、夜叉鴉の本拠地・熊野真宮へ乗り込む。宮司の那智武流（なち・たける）は、夜叉鴉の正体を隠したままみづはと対決するが敗北し、勢伊子を連れ去られてしまう。彼女を救うため、那智は夜叉鴉となるが……。

影忍一族の幽蝸みづは（ゆら・みづは）との死闘の末、死人となって勝利をおさめた那智武流（なち・たける）。時は過ぎ、怪事件が相次ぐ東京で、番長皿屋敷のお菊だと噂されるミイラが安置される病院に那智の死体が運び込まれる。そこで「オヤカタサマ」を追っていた少女・朱姫（あけひめ）は、死体の那智と対面するが……!?

この世に蘇った那智武流（なち・たける）は、邪悪な悪霊までも蘇らせてしまった。那智の姿を借りた悪霊は、朱姫（あけひめ）を人質に那智の肉体と取毛トマス（とりげ・とます）の肖像画を要求する。朱姫の従者・熊若（くまわか）は、本物の那智を確保するが、シスターマリアに肖像画を持ち去られてしまう。肖像画を手にしたシスターマリアは、地獄の扉を開こうとするが……!?