士郎正宗の『攻殻機動隊１．５』のつづきの世界。草薙素子が姿を消した後の公安９課を描いた『攻殻機動隊』最新作！　
東北のトワダで、草薙素子の汚染された義体が見つかったという報告を受けて、捜査に向かったトグサと霊能局からやってきた新メンバーのツナギ。事件と関連のある宗教団体「アテルイ」に潜入するが、サイトーの宿敵ともいえる強敵に出くわす。一方、沖縄でも素子の影があったということで、バトー、アズマ、イシカワが捜査にあたるが、中国マフィアの襲撃を受ける。北と南の事件が線となり、関係者の陰謀が浮かび上がってくる。公安９課は事件が明るみになる前に食い止められるのか!?

士郎正宗の『攻殻機動隊１．５』のつづきの世界。草薙素子が姿を消した後の公安９課を描いた『攻殻機動隊』最新作第２巻！　

公安９課から姿を消した草薙素子の義体が見つかった報告を受けて、捜査を始めたトグサと新人のツナギ。宗教団体「アテルイ」を調査中に高出力の義体部隊の襲撃を受けて、ツナギが負傷する。さらにツナギは、サイトーも警戒する最強の狩人「シロクマ」に連れ去られてしまう。一方、義体メーカー「オオサキ工業」を捜査中のバトーとイシカワは、事件と関連がある階上承を見張っていた。しかし中国マフィアから逃げるために、階上が仕掛けた攻撃によりイシカワが乗っ取られてしまい、バトーと戦うハメになる！！

トグサの前には「シロクマ」が、バトーの前には「イシカワ」が敵として現る！！

士郎正宗の『攻殻機動隊１．５』のつづきの世界。草薙素子が姿を消した後の公安９課を描いた『攻殻機動隊』最新作第３巻！　

公安9課を去った草薙素子の義体が東北のトワダで発見されたため、捜査を開始したトグサと新人のツナギ。一方、沖縄近海でも草薙発見の報告が届いたため、暴力団組織に潜入しているイシカワとバトーが捜査にあたった。北と南の捜査が進むにつれ、”白熊”と呼ばれる暗殺者と階上承の2人が、新浜市新市長の神子元シンラ殺害を目論んでいるとわかった。地方に散らばっていた9課メンバーは神子元を守るために、最終決戦の地・ニューポートに集結した!!

新市長の生死によって、草薙素子から始まった一連の事件が完結する!!