「立ちました！」何の変哲もない男・モブ男（お）の前に現れた死亡フラグちゃんこと「死神No.269」。実はモブ男がいるのは失敗続きのフラグちゃんを見かねた神様が彼女の練習用に用意した仮想世界。だが、フラグちゃんはモブ男の命を奪うどころか、あろうことかモブ男に惹かれてしまった！　それでも彼女を温かく応援する神様やドSだけど実は優しくなりたい生存フラグさん、イタズラ大好きの恋愛フラグがフラグちゃんの周囲に集ってきて、事態はいつも思いがけない方向に。はたしてモブ男への想いで揺れるフラグちゃんは、立派な死神になることができるのか!? そしてモブ男は生き残ることができるのか――!?【電子限定！書き下ろし特典つき】

謎の人物「Ｘ」の仕業で、仮想世界から天界に戻れなくなってしまった死亡フラグちゃんと仲間たち。原因究明のためファンタジー風の異世界でしばらく生活することになり、フラグちゃんも奮闘。超速で最強の冒険者に成りあがる生存フラグ、異世界でもマイペースな恋愛フラグらと共同生活を送ることに。そして、そんな世界でもモブ男（お）は、様々なスキルを持つ冒険者の姿で湧いてきては多様なフラグを乱立させまくりで、フラグちゃんは振り回されてばかり。はたして死亡フラグちゃんは、閉じ込められた異世界から無事に戻ることができるのか!?　そして、気になる「Ｘ」の正体は誰なのか――？【電子限定！書き下ろし特典つき】

謎の「Ｘ」の正体が明らかになり、無事に閉じ込められた異世界からの帰還をはたした「死神No.２６９」こと死亡フラグちゃんと仲間たち。モブ男のいる仮想世界を練習場とするいつもの生活に戻った矢先に、今度はフラグちゃんの前に死神No.５１こと「失恋フラグ」が現れた。偶然からモブ男に恋をし、モブ男への好意を隠さない失恋フラグに一方的にライバル宣言をされたフラグちゃんは動揺。失恋フラグとのフラグ回収競争に挑むことになる。その要素を面白がる恋愛フラグたちを尻目に、神様は最近の仮想世界システムの不調を死神No.１へ相談。事態は、誰も予想もしなかった展開へとなだれ込んでいく――！【電子限定！書き下ろし特典つき】

モブ男を巡るライバル（？）の失恋フラグの登場をきっかけとした騒動で、またちょっぴり成長した死亡フラグちゃん。仲間たちとの賑やかな生活を過ごす中、今度はあからさまな罠に引っ掛かり、ショッピングモール併設の映画館に閉じ込められることになってしまう。そこに現れたのは、「仮想世界を破壊できる」と豪語し、神様を脅迫して意のままに操る“監督”を名乗る人物。目的も不明のまま、次々と映写室という名の仮想世界に送り込まれるハメになったフラグちゃんたちに、はたして逆転の勝機はあるのか!?　そして、“監督”の正体は一体誰なのか――!?【電子限定！書き下ろし特典つき】

“監督”による映画館閉じ込め騒動も終わり、日常へ帰還したフラグちゃんたち。賑やかなフラグ回収の練習が再開──と思いきや、モブ男の身体に異変が起きる。モブ男が元々持っていた『バグ』が想像以上に深刻化し、身体が崩壊し消え始めていたのだ！　助けを求めるも神様すら修復が不可能なエラー。このままでは完全に存在が消去〈デリート〉してしまうモブ男を、フラグちゃんは何とか助けようと試みる！　
神様も諦めず、一緒に『仮想世界』を作った死神No.1に協力を依頼する。
しかし、死神No.1こそがモブ男のバグを悪化させた張本人で──!?