もし日米闘わば、空母機動部隊を用いて敵艦隊を殲滅すべし――。航空攻撃による短期決着。それが海軍航空本部長だった山本五十六の持論だった。だが一方で、航空母艦の脆弱性も熟知する山本は、もし日本の空母が先に殺られれば、その優勢は国力差によってすぐに覆されてしまうだろうことを危惧していた。防御が弱いなら水中に潜ってしまえばいい。かくして山本が潜水艦の第一人者野村直邦と組んで立てた計画、それが独立潜水空母艦隊・秘匿名『Z艦隊』の設立だった。日米開戦から半年、破竹の勢いで広大な制海権を手にした海軍は、次なる最終決戦を決意する。そして、その前哨戦なるミッドウェイにおける聯合艦隊への支援が『Z艦隊』の初めての任務だった。隠密行動、欺瞞通信、囮作戦――あの手この手で合衆国艦隊を翻弄する『Z艦隊』。連合艦隊のお株を奪う奇想天外の活躍に、合衆国艦隊は大混乱に陥った！

ミッドウェイ海戦の大勝利で、秘密潜水空母『Z艦隊』は、その活躍を広く軍部に知らしめた。彼らの有効性を認めた海軍上層部は『Z艦隊』を正規部隊に取り込むべく画策。自前の潜水空母艦隊を新設し、『Z艦隊』を戦隊所属の独立機動部隊扱いにしてしまう。大幅に格下げされ、前途に暗雲が立ち込める『Z艦隊』。だが、さらに戦局は動いた。1942年9月、連合艦隊はトラックから出撃。米豪連絡線を遮断し、南太平洋を制圧する作戦に乗り出した。帝国海軍の総力を挙げた戦いに初めて正規部隊として挑む『Z艦隊』は空と海上、そして海中から変幻自在の攻撃を実施する。巨大潜水空母『飛天』以下の超高速潜水艦隊。そして驚異の新兵器『試製対潜爆雷』。所属艦隊との軋轢をものともしない『Z艦隊』の進撃は、米艦隊を恐怖のどん底に陥れた！大好評、奇想天外の架空戦記シリーズ。待望の第二巻！

南太平洋作戦に、連合艦隊の正規部隊として参加した『Ｚ艦隊』は変幻自在の活躍で日本軍に勝利をもたらした。ところが、潜水空母艦隊のさらなる大戦果を期待した東条首相と海軍主戦派は、山本五十六ＧＦ長官不在の隙を突いて海軍編成の抜本的組織改革を強行。これによって新造潜水空母『海洋』を中心とする『第一潜水空母艦隊』が設立され、『Ｚ艦隊』は再び独立艦隊として運用されることになってしまった。翌年３月、連合艦隊は再度ミッドウェイ攻略に乗り出す。だが、彼らを待ち受けていたのは米太平洋艦隊の逆襲だった。スプルーアンスの奇策によって『第一潜水空母艦隊』は大被害を受けてしまったのだ。連合艦隊の危機を救うべく動き出した『Ｚ艦隊』。長官・九十九海山は敵をも上回る鬼謀をもって逆襲に転じることができるのか！？奇想天外の架空戦記シリーズ、ついに完結！