電車大好きな小学生が集まり、とあるグループが結成された。その名は、「トレイン・トラベル・チーム」！　メンバーの雄太たちは、初めての旅行に出かけようとしたものの、駅構内で事件に遭遇してしまう。初めてのミッションは、数十本ある新幹線の中から、たった一人の乗客を見つけること!?　タイミリミットは二時間！　時刻表や路線図をフル活用して、人探しに挑戦だ！

電車が大好きな小学生で結成された「トレイン・トラベル・チーム」。ある日、メンバーの未来が一枚の写真を持ち込んだことで、またもや事件が！　15年前に写された電車と場所をさがすため、リーダーの雄太をはじめ、メンバー一同は関東一周の旅に乗り出す。いろいろな電車に乗って、絶対見つけ出してやる！　と思っていたのに、関東一周の費用がたった６０円ってどういうこと!?

電車大好き小学生で結成した「トレイン・トラベル・チーム」。スーパービュー踊り子号で、の～んびりと箱根旅行のはずだったが、またまたトラブル発生！　雄太たちは、とある人物の乗ったバスを追いかけることになってしまった！　「車に追いつくには、電車のいいところを利用すること！」意見の一致したメンバー全員で、ミッションを開始。さまざまな電車を使ってバスを大追跡だ！

電車大好き小学生で結成されたチーム「Ｔ３」のリーダー・雄太は、奈良のおじいちゃんちへやって来た。「同じ鉄トモやないか。俺たちが協力したるわ」ふとしたことで知り合った、大阪育ちの私鉄好き・上田、神戸在住の録り鉄・みさき、さらに京都出身で電車に無関心のいとこ・萌とともに、初の関西ミッションに挑む！　東京にはない、三段階に変形する不思議な電車ってなんだ!?

電車大好き小学生で結成されたチーム「Ｔ３」が、夢の寝台特急・北斗星に乗って、北海道をめざす！　東京の上野から札幌まで16時間の鉄道旅行♪のはずだったのに、メンバー全員が乗り遅れ!?　「特急を追い越すなら、超特急のアレだ！」時刻表と路線図を使って、北斗星を追いかけろ！　しかし、車内でも事件に巻き込まれ……。今回の旅も、超難解ミッションが続出だー！