時は戦国、争いと裏切りがはびこるこの時代に、金でやとわれ戦を渡り歩く三人の戦士がいた。戦国史上最強と言われる彼らの名は、旋風（つむじかぜ）三人衆!!　――子供のように無邪気で、常に食うことばかり考えている彦佐（ひこざ）。しかし真の顔は、三人衆の首領にして、鎧をも断つという伝説の名剣・七星剣を振るう「疾風（かぜ）の彦佐」!!　「月影の飛竜（ひりゅう）」「ムササビの小源太（こげんた）」とともに戦乱の世を駆ける!!

お宝を隠し持つ、海賊の末裔の村の護衛に雇われた彦佐（ひこざ）ら、旋風（つむじかぜ）三人衆。冷酷非道な剣の達人“氷の死紋（しもん）”の軍団からお宝を護るために激突するが、その時、死紋らはすでにお宝の一つ“南蛮渡来の不老不死の薬”を飲んでいた!!　どんな攻撃も利かない不死身の軍団に取り囲まれ、満身創痍の旋風三人衆、万事休す!!

故郷・雑賀（さいが）に里帰りしていた彦佐（ひこざ）の前に、再び強大な敵が迫る！　数々の村を皆殺しにして荒らしまわる大海賊“海ムカデの仁羅（じんら）”!!　その首領は、かつて旋風（つむじかぜ）三人衆が倒した、あの“氷の死紋（しもん）”の弟だという。弟のように可愛がっていた子を殺された彦佐は、怒りのあまりに我を忘れ、戦に不慣れな町の衆を弔い合戦に駆り立てようとするが……。

“海ムカデの仁羅（じんら）”との戦いで援軍として駆け付けた瀬戸内海賊・土生剛介（はぶ・ごうすけ）と、彦佐（ひこざ）の出会い編!!　――水がなく、植物が育たない不毛の島・蛍（ほたる）島で島長を務める土生は、イカサマ賭博や海賊仕事で金を得て、島の人間が生きるのに必要な野菜を手に入れていた。土生の妹が野菜不足で命を落としたことを知った彦佐は、畑を耕し始めるが……!?

飛竜（ひりゅう）の左腕の傷を治すため、先進医術の伝わる琉球（りゅうきゅう）へとやってきた旋風（つむじかぜ）三人衆と瀬戸内海賊の大将・はっちゃん。平和を愛する琉球の国だが、ここ数か月、働き盛りの若い男女が次々と神隠しにあうという事件が起きていた。その実体は、明（みん）海賊の奴隷狩り。さらには、明海賊総大将の趙盾元覇（ちょうじゅん・げんぱ）が、琉球王国を手中におさめようとしていた……!!