高校３年の６月。俺はあやせから、相談を受ける。「お兄さん、桐乃のことでご相談があります！」あやせは妹の親友で、俺のことを嫌っている……これからもそのはずだった。
　なのに相談に乗っているうち、「わたし、お兄さんにずっとひどいことを――」誤解は解け、俺とあやせの距離は急速に縮まっていく。
「……へ、部屋で二人きりだからって変なことしないでくださいね？」
「やっぱり！　な、何を考えているんですか変態！！　つ、通報しますよ！」
　あやせとアキバデートをしたり、一緒に妹ゲーをプレイしたり、夏コミに参加したり――どうしてこんなことに！？
　これから語るのは、『俺と妹』の物語ではない。――俺とあやせの物語だ。

　高校３年の夏、俺はあやせの告白を受け容れ、恋人同士になった。
「……桐乃には、内緒ですよ？」
　初めてのデート。
　そして、初めてのキス。
　新しい関係に戸惑いながらも、俺たちは残り少ない夏休みを二人で過ごすべく計画を立てる。
「……わたしも……恋人と海とか……行きたいです」
　水着を選んで海水浴に行ったり、俺たちの関係を知った加奈子が、高坂家に襲来したり。様々なトラブルがありつつも、俺たちは毎日のように逢瀬を重ね、絆を深めていくのだった。
　そして、ついに桐乃が、俺たちの関係を知ることになり――。
　新垣あやせifルート、堂々完結！

「花火の下、俺は黒猫に告白する」
　高校３年の６月。ゲーム研究会の部長から夏休みの取材合宿を提案された俺たち。最初は参加するつもりのなかった黒猫だが、父や妹からの後押しを受け参加を決める。
　合宿が始まると、俺は黒猫と一緒に、新幹線の中で赤城兄妹と歓談したり、フェリーの甲板で夕陽を眺めたり、露天風呂に入ったり、肝試しをしたり、花火をしたり。自然たっぷりの離島で、最高の夏休みを過ごす。そんな日々の中、俺たちは槇島悠（まきしま・はるか）と名乗る少女と出会う。占いやオカルトに精通する悠は、黒猫と意気投合し、島に伝わる“天女伝承”の取材に同行を申し出る。
　そこで俺たちは、不思議な体験をする。