貢の母・和子のところに、「衛生ボーロ殺人事件」と書かれた原稿が送られてきた。内容は、和子の高校時代の部活の仲間が、当時のコーチだった先生の誕生日に集まる席で事件が起きるというもの。作者は「中野芳江」とあるが、和子は３年前に死んだ「上野久江」をかたっているのではないかという。そして誕生日の当日、10人の教え子が集まった中、そのうちの2人が死んだ。不思議なことに2人の鼻の穴の中には衛生ボーロが……。有季と貢に新入りの真之介も加わった２Ａ探偵局の面々が不可解な謎に挑む。

テストの前日に一夜漬けに励む俊男の目の前に１枚の紙が。それはなんと明日のテストの答えだった！　半信半疑、答えを写したところ、思わぬ高得点をとった俊男。以来俊男は高得点を連発。カンニングを疑うも証拠がないので、思い余った学校側は２Ａ探偵局に調査を依頼した。しかし、それをあざ笑うかのように犯人から「教師攻略法」「内申書公開」などの攻撃が続き、さらには体罰教師が殺される事件まで発生した。いったい犯人の目的は？　2A探偵局のライバル探偵局も登場し、いよいよスリル満点の学園ミステリー。

１年２組の泰志が書いた「三つのねがい」という作文。そこには父親の死と、自分をいじめる３人組が消えてなくなること、そしてみんなが学校に来れなくなればいいと書かれていた。そして起こった父親の交通事故死と３人組の失踪。その不気味な符合に慄然とした国語教師の郁子は、有季と貢の２Ａ探偵局にボディガードになってほしいと頼む。捜査に乗り出した２人は、泰志が誰かに操られているのではないかと推理、そして裏に“呪われた少年”がいることを突き止めた。だがさらに隠された真実が二人を待っていた……。イジメ、虐待といった子供たちをめぐる問題に中学生探偵が真っ向勝負！