『モテキ』の久保ミツロウが描く、高校生活タイムスリップストーリー！　――高校生活3年間、友達も思い出も作らず卒業式を迎えた今村金一郎（いまむら・きんいちろう）。だが同級生の女子・暁（あきら）と階段から転げ落ち、気づいたら3年前の入学式の日へタイムスリップしていた！　憧れていた女団長・宇佐美（うさみ）と再び出逢った金一郎は、応援団に入団し、宇佐美が独りで頑張る応援団の立て直しを目指す!!

応援団の存続を目指し、金一郎（きんいちろう）は、今は辞めてしまった元団員の復帰に狙いを絞る。だが元団員は『土下座の達人』チャンクマに、上下関係が大好きなパイセン野郎、高いコミュニュケーション能力を持つ本格リア充とヒトクセある奴ばかり。合同応援練習が迫るなか、金一郎が元団員達と正面衝突!?

金一郎（きんいちろう）の初応援となる野球部定期戦が迫る！　相手は応援団の名門校・かぼ国。だが、野球部期待の一年生エース・鈴木（すずき）は、失恋のショックで試合どころじゃない！　しかも宇佐美（うさみ）は、かぼ国の応援団長が好き!?　モチベーションだだ下がりの金一郎を鍛えるために応援団は地獄の合宿に突入するも、身勝手なパイセン達に金一郎の怒りが爆発!!　どうなる応援団!!

応援合宿二日目。一日団長に任命された金一郎（きんいちろう）は、チア部との応援練習で、宇佐美（うさみ）とアベタマの振り付けを入れ替えるという暴挙に出る。金一郎の狙い通り応援練習は盛り上がったが、恥ずかしさMAXの宇佐美がブチ切れ！　それをきっかけに応援団の面々は本音を話し出す。応援団がようやくまとまり始めたと思ったその矢先……!?

再び三年前の世界に戻った金一郎（きんいちろう）は、宇佐美（うさみ）にアゲインのことをぶっちゃけ、彼女の悲惨な運命を変えるため行動を開始！　未来を左右する野球部対抗戦まで、あとわずか。応援団はガッチリ団結して新しい応援を作ろうとするのだが、なぜか金一郎と宇佐美の仲に尾ヒレがついて大スキャンダルに巻き込まれたり、金一郎への気持ちに気づいたレオが泣き出したり、前途多難。“アゲイン”で、世界を変えることはできるのか!?