門司港上陸から福岡市街地の占拠まで、共生派の爆弾攻撃以外に幻獣からの大規模な攻勢はなかった。そのことに状況を楽観視した派遣司令部は、政治家を介入させる形で危ぶむ善行らの意見を封じ込め、熊本まで一気に侵攻するという大胆な作戦を決行。だが善行の悪い予感は的中する。先頭を切り、熊本へと先を急ぐ戦車師団と、その後に延びていく補給線。幻獣は満を持していたかのように、無防備な補給線の真横から自衛軍に襲いかかった。退路を断たれ孤立する師団、取り残される学兵、そしく悲鳴の果てに沈黙する兵士たち。その最中、森精華からの連絡が途絶えた……。

自衛軍の最精鋭、虎の子といわれる第三師団、第三戦車師団が、熊本への進軍途中に補給路を断たれ、孤立した。救出に向かった芝村支隊を含む編成軍は、筑後川の北側を埋め尽くす幻獣の海を見て愕然とする。退路は無い。相当の損害を覚悟した。決死の撤退が始まった。　圧倒的な数の幻獣を相手にした長時間に渡る戦闘に、疲弊していく5121のパイロットたち。そこへ「善行被弾」の報せ届き、隊全体に動揺が走る。そしてついに壬生屋の精神は限界を超え……。
一方、消息を絶った整備班の森は、幻獣共生派の手に落ちていた。捕虜となり、山中を連れ回され、疲れ果てた森の前に、あの青いスキュラが姿を現す……。

2個師団の救出作戦で疲弊した5121小隊は、命令による強制休暇を経て、徐々に本来の力を取り戻しつつあった。一方、被弾後に意識を取り戻した善行は、そのまま上京。政治家たちへの戦況報告のかたわら、情報将校・落合大尉が巻き込まれた事件を調査し、軍閥が絡む裏情報を入手する。しかしその直後、車で都心部を走行中に銃撃を受け……。　同じ頃、九州・響灘沿岸では相当数の幻獣が海から逆上陸を開始。さらに、空中要塞として知られる幻獣・スキュラの体当たりからの自爆攻撃が始まった。　予期せぬ奇襲、そして特攻とも呼べる攻撃に浮き足立つ自衛軍。その背後には幻獣を統べる知性体の陰があった……。

大原首相の密命を受け、ついに「百二十一作戦」が動き出す。人類側の切り札ではあるものの、もし露見すれば国家反逆罪は間違いなく、さらに失敗した場合は首相ですら投獄必至の諸刃の剣。選抜隊の編制も秘密裏に行われ、数日後、5121小隊を含む寄せ集め部隊が、熊本奥地の忘れ去られた集落に展開した。しかし、それを見計らったかのように幻獣群の圧力が増大する。狩っても狩っても無尽蔵に溢れ出す幻獣の攻撃に、数日間さらされ続けた兵士らは完全に疲弊。そんな中、頼みの綱である人型戦車が被弾する。　そうした状況を冷静に見ていた厚志が、カーミラに進言した策とは……？5121小隊、薄氷のラスト・ギャンブル！

岩国戦での華々しい戦功を認められながらも、東京に召還された善行は軍規違反の咎により、昇進と降格を相殺され、大佐のままに据え置かれた。一方、彼の古巣の海兵旅団は根拠地の横須賀から呉へと移動し、本土に唯一残った幻獣領・萩戦線で、上層部の許可がないままに前旅団長以下の幹部は独断で無謀な戦闘を繰り返していた。「大冒険、はじめてみるかね？」芝村中将が善行に放った冗談交じりの一言は、言葉とは裏腹に切実なものだった。腐敗した海兵旅団をなんとしても再建させなければ――。新旅団長に任命された善行は、伝家の宝刀5121小隊とともに、改革の大鉈を振るうのだが……。