女王さまは名探偵！　ヒミコとタイムスリップ探偵団

「助けて　麻美」と書かれた紙が、大阪城から発見された茶入れに入っていた。香里、拓哉、亮平は早速戦国時代へと救出に向かう。大坂城の天井裏へタイムスリップした3人が出会ったのは、天下の大泥棒、石川五右衛門親子。彼らは、豊臣秀吉が宝としている「九十九髪」という茶入れを手に入れようとしているところだった。そうはさせじと秀吉も秘策で対抗。火花散る攻防戦の幕が開く！

いきなり目に飛び込んできたのは、羽織姿の男たちが剣を手に激しく戦うというおそろしい場面！身の危険を感じた香里、拓哉、亮平は何とか身を隠して、その場をかわすのだったが、またもや幕末にタイムスリップしたらしいことに気づく。そこは，新選組がその名を広く知らしめた「池田屋事件」の現場みたいだからだ。案の定，香里たちの前に、まずは沖田総司が登場するのだが……。

いつものように突然時空を超えた香里、拓哉、亮平の目にまず入ってきたのは、五重塔……ということは、今回は飛鳥時代!?　つまり聖徳太子に会えるかもしれないってこと？　と、そこへ、一人の男性が登場。頼りなさそうなその人によると、後に聖徳太子となる廐戸皇子は一人だけじゃなく複数いて、自分もその中の一人なのだというからびっくり！　いよいよ聖徳太子の謎が明らかに！？

なぜかひとりだけタイムスリップしてしまった香里の目の前に現れたのは、ひとりの一風変わったおじさん。それもそのはず、その人は、あの平賀源内だったのである。自らを天才発明家と称しては、次から次へと奇妙なものを作り出す彼に、香里や、続いてやってきた拓哉、亮平は驚かされっぱなし。そして、時の実力者・田沼意次が加わって、騒ぎはさらに大きくなる一方に……。

さまざまな時代にタイムスリップしてきた香里、拓哉、亮平の3人はまたもや時空を超えて、幕末の土佐へ。少年時代の坂本龍馬と出会った彼らは、さらに薩長同盟当夜の京都へとタイムスリップしてしまう！日本史最大の謎のひとつ、龍馬暗殺の犯人は誰なのか？そしてなぜ3人はいとも簡単に時を超えてしまうのか？事件に巻き込まれるうちに、いくつかの謎がいよいよ解き明かされていく！