大奥のサクラ　現代大奥女学院ほんまるっ！

満身創痍になりながらもなんとか『大奥』へと舞い戻ったさくらたち。しかし『蠅王』の操る最強の亡霊達が、彼女たちの行く手を阻んでいた。さくらと秀影、ふたりの愛は日本の夜明けをつかみ取れるのか!?

『モモ』との死闘を乗り越え、『大奥』へと急ぎ戻るさくらたち。一方、『大奥』は、序列１位『蝿王』の悪意に絡め取られていた。一足先に大阪城へ舞い戻った秀影が見たものは、惨殺された『大奥』の生徒達の姿で!?

『鎌切』との戦闘で負傷したさくらを治療するため『阿呆鳥』が帰ってきた。さくらを心配しまくる豊臣秀影の元に、敵勢【黒船】のピカドールが助けを求めにやってくる！　さらには『吸血姫』に将軍だと正体がばれ!?

『蛍』の計らいで豊臣秀影とラブラブな逢瀬をしていたさくらの前に、「お兄ちゃん将軍～っ♪」と秀影に懐いている、序列２位の『鎌切』が現れる。彼女は『絲妃』が統治していた暗黒時代の方が「正義のため人を殺せたもんっ！」と不穏なことを呟く。そして城下町で生徒２人が惨殺される事件が起こり、解決のためさくらは大奥を出るが!?　豊臣幕府率いる『奥』VS異国の軍勢『黒船』VS戦闘集団『新撰組』──少女たちの戦国時代！

新将軍の豊臣秀影が治めることになった大奥女学院。さくらに一途な想いを寄せているはずの秀影が、学び舎の主になるということは……つまり!?　心中穏やかではないさくらに追い打ちをかけるように、革命の嫌疑で地下監獄へ入れとの命が下される。だがそれは『吸血姫』と呼ばれる姫さまとの出会い、そして正体不明の異国の勢力『黒船』による生徒消失事件に繋がっていたのだ！　新時代が開幕した学院でさくらは“大奥”の頂点を目指す！