世界中の偉人のクローンのみが通うセントクレイオ学園において、
唯一の非クローンである神矢史良。その学園の一大行事である「学
術研究発表会」が、謎のテロリスト達によって襲撃された。テロリ
スト達の正体は…なんと学園の卒業生、つまり偉人のクローンだっ
た。さらに、その中には史良と良く似た顔を持つ男が3
人！？史良に似た男の一人によって磔にされたジャンヌ・ダ
ルク…その運命は？史良は、ナポレオンはジャンヌを救うことが
出来るのか！？謎が謎を呼ぶ、新感覚学園ファンタジー！！

偉人クローン達が通うセントクレイオ学園を襲撃した集団のひとりであり、見た目が史良に酷似した男＝カイ。そのカイが、自らの青春時代…つまり、前世代クローン達の学園生活を語り始めた。それは、今の学園とほとんど変わらぬ平和な日々。しかし、カイの前にもう一人のカイが現れてから、人間関係に微妙な亀裂が走り始める。そんな中で行われた学術研究発表会。それは、紛う事無く「クローン達のオークション」であった。ヒトラーを始めとして、それぞれ「買い手」が見つかり卒業してゆく生徒達。そして、学園に残されたカイ達を待っていた過酷な運命とは…？

史良に酷似した男＝カイが語る、学園の過去――。
学園を卒業した前世代のクローン達しかし、彼らを待っていたのは、
オリジナルの偉人のイメージに縛られ続ける苦難の道だった。
そんな中、「傷を持つカイ」は銃を手にして、
心が壊れる寸前であるクローン達を訪ねる。
そう、彼らの魂を救済するために。それが、セントクレイオ学園
を襲撃した集団・ストライカーの始まりだった…。
カイの話を聞き、困惑する史良達。中でもエリザベスは、
カイの導きにより信じ難い光景を目の当たりにすることに…！？