“非公認魔法少女”──それは使命を果たしたあともなお闘い続ける少女たち。　高校生・牧瀬琢磨の彼女、美守ほのかは、かつて伝説と謳われ、任期後も傭兵として戦う”非公認魔法少女”だった。　ある日、彼女は自分を訪ねてきたかつてのパートナー、ミケルから「三億円と引き換えに、闇に墜ちた魔法界を救う」という依頼を打診される。　そしてほのかと琢磨が知ったのは、現役の魔法少女が根こそぎ悪に堕ちたという絶望的な状況で……終わり損ねた魔法少女たちの、血で血を洗う戦いが始まる。

“非公認魔法少女”――それは使命を果たしたあともなお闘い続ける少女たち。　歴代最強の魔法少女たる“必殺の弾丸”こと美守ほのか。彼女が受けた新たなる任務は……新たに公認魔法少女に選ばれた親友・一宮真音のサポート!?　恋人・牧瀬琢磨の幼馴染にして、隠れた恋敵でもある真音のサポート任務は波乱続きで、やがて危機的状況に陥り……。番狂わせばかりの苦闘の裏には、かつての仲間の暗躍が!?　かくて公認魔法少女をも巻き込み、終わり損ねた魔法少女の血で血を洗う戦いが、いま再び始まる。

世界を再構成し、あらゆる魔法少女をハッピーエンドへと導く究極の魔法。最強の魔法少女“必殺の弾丸”ほのかは、自らの恋のためにその救いを拒否し──世界を、滅ぼした。　彼女の願いのままに再生された軋む世界で、〈魔法少女〉の魔法少女はほのかの恋人・牧瀬琢磨に最後の機会を与える。　魔法少女として再構築された琢磨と真音。魔法少女を巡るシステムと対峙した彼らは、世界の終わりを回避するのか、それとも──これは終わり損ねた全ての魔法少女たちの、終局と再生の物語。