「死ぬときは、たとえどぶの中でも、前のめりになって死にたい。」――公式戦も終盤の巨人vs.阪神戦で、星飛雄馬（ほし・ひゅうま）は宿敵・花形満と対決した。花形は、決死の新打法で飛雄馬の魔球を外野スタンドに打ち込んだが、その直後グラウンド上に倒れてしまう……。あまりの激しい打法のため、全身傷だらけになっていたのだ。飛雄馬は、敗れながらも、深い感動の中で新たな闘志を燃やすのだった！

「おれは野球ロボットにすぎなかったのではないか！」――飛雄馬（ひゅうま）の胸によぎる暗い疑惑と清純な青春の慟哭（どうこく）！　日米親善試合でカージナルスの秘密兵器・オズマと対決した飛雄馬。血みどろの死闘の末、オズマの大リーグボール破りの秘策に打ち勝つことが出来た。だが、オズマは言い放つ。「……日米野球ノロボット同士ノ因縁ノ血闘（ケットウ）ガ、コレカラハジマル！」……やがて契約更改の季節。飛雄馬は、未更改のまま新年を迎えることとなった。第１部完結編!!

「死ぬよりつらい事情があろうとも、起て、戦え」――青春の慟哭（どうこく）の中から、マウンドに命をかける熾烈な闘魂を甦らせた不死鳥飛雄馬（ひゅうま）！　野球ひとすじに生きる巨人軍の星飛雄馬投手にも、甘い青春への夢が芽生えていた。そんなとき、宮崎のトレーニング・キャンプで美しい少女・美奈と知り合い、飛雄馬は初めて青春のよろこびを味わった。しかし、それもつかの間、美奈は病魔に倒れ、絶望の飛雄馬は練習にも力が入らず、ついに二軍落ちを宣告されてしまう……。

「とうちゃんは敵だ！」僚友・伴宙太（ばん・ちゅうた）と共に、新魔球完成に全生命を賭ける飛雄馬（ひゅうま）――！　父と子が、先輩と後輩の男と男が、血で血を洗うすさまじい闘い！　愛する美奈の死から大リーグボールを失い、二軍に転落した星飛雄馬に苦悩の日々が続いた。しかし、ライバルである花形、左門の友情のむちを受け、飛雄馬は不死鳥のごとく甦り、見事、一軍へのカムバックを果たすのであった――！

「果てしなき戦いあるのみ！　栄光のあとにも、敗北のあとにも！」――巨人軍の若きエース・星飛雄馬（ほし・ひゅうま）は、魔球“大リーグボール”で、各球団の打者を翻弄（ほんろう）していたが、父・一徹の大リーグボール攻略特訓を受けた怪物・オズマに痛打を浴び、敗れた。自信を失った飛雄馬は、二軍に落ち、失意の日々を送っていたが、不屈の投手魂で奇跡の消える新魔球“大リーグボール２号”を完成させ、カムバックを果たした！　そして雪辱の決意に燃え、再び因縁の宿敵・オズマとの対決のマウンドに立つのだった……。