ゲンたちは魅努川温泉の廃墟ホテル群を爆破解体するプレテストとして、隣県にあるバブル時代に建設された「ホテル馬部流（バベル）」を爆破解体することに。バブル時代とは何だったのか…「プレテスト」、新型コロナウィルスの影響で潔癖症の症状が悪化した敦子は外に出れなくなる。そんな敦子のために谷は箱庭メタバースを用意する…「敦子の離脱とメタバース」、中国の惑小集団の不動産バブルが崩壊寸前、ゲンたちはそれを食い止めるために10日間でマンション５棟の爆破解体に挑戦する「超スピード爆破解体」他。

中国不動産バブルの清算をすべく、26棟のマンション同時解体に挑むゲンたち。たった10日間の施工期間で５棟の爆破解体を担当するゲンに勝算はあるのか、そしてゲンは新たに工業用爆薬を開発する…「超スピード解体」、大日本化薬の曽我は子どもの頃から花火好きだった。勉強そっちのけで花火に夢中になる曽我も中学生になり、自分の進路に向き合う時が来る…「多能工と専門職」、有華の母親が家出!?老舗に嫁いだ嫁が自分のやりたいことに目覚める…「老舗の嫁」他。

かつてゲンたちがドハマリしたゲーム『ワクワクガールズ』を制作したゲームプロデューサーの三上がゲンを訪ねてくる。ヒット作を出せない三上を助けるために、ゲンと谷はボテを使ってゲームを作ろうとするが…「飛び出すな！へいたん娘」、魅努川温泉の廃墟ビルを爆破解体するためには２つの片付けなくてはならない課題があるという…「２つのボトルネック」、コロナにより仕事を失っていた岡本の元に傾いた社（やしろ）を修繕する仕事が入る。しかしそれは小高い丘の上にあり、すべての道具を人力で担ぎ上げなければならない難工事だった…「技量と力量」他。

掃除が価値を生み出す…そう言ってさくら商店街に売り込みを掛けてきたバリュバリュクリーニングの狙いとは…「商店街の秘訣」、古い倉庫の解体に参加したゲンは近所に住む老人からこの近くに防空壕があったという話を聞く。どうやらそれは解体中の倉庫の地下部分にあるらしい…「平和が一番」、ゲンは工事中のビルの屋上にこれまで見たことのない養生方法を見つける。その特許工法とは…「ケージシステムとは？」、ゲンたちはいよいよ魅努川温泉の廃墟ビル群の一斉爆破解体工事に挑む。しかし工事は長雨に悩まされ…「廃墟ホテル群爆破解体」他。

連載20年目に突入した『解体屋ゲン』はいよいよ節目の100巻！魅努川温泉の廃墟ホテル群の爆破解体はついに完結…「廃墟ホテル群爆破解体」、中国西南島の三葉リゾートマンション群で一緒だったウェンディと産業スパイの愛美が突然転がり込んでくる「二人の居候」、急接近する関根と秀美に焦りを感じる谷は自暴自棄に、一方内田はDRT（災害救助トレーラー）に建設業の未来を見出すがそれには谷の助けが必要で…「谷のピンチと内田のチャンス」他。