孤独な少女、桃果の日常は拾った魔法の本から現れた“本の妖精”ベニーと出会ったことで大きく変わっていく。しかし、桃果とベニーの幸せな時間は長くは続かなかった。「恨み事」に囚われて魔法を使い続けた桃果は、魔力に心と身体を侵食されていった。魔獣化した桃果に“魔界の眼”によって処刑の審判が下されようとした時、万年お気楽娘ルシカの奇想天外な作戦が炸裂する……!!　タイムスリップ編、最後の大事件の結末は!?

二年前の世界から無事に帰還したルシカたち魔法中学生。「呪文字魔法」の実証実験が評価されたのか特別予算が下りると、さっそくカワイイ水着を新調して真夏のプールへレッツゴー！　あ、遊びじゃないよ、ホントだよ！？　大勢の人間が集まるプールで「呪文字」集めという大義名分があるのだ！　と言いつつも地上の夏を楽しむ気満々だけどね。ところが、プールに謎の巨大ゴーレム軍団が来襲！！　私たちに平穏な日常はないの！？

地上での「言ノ葉の書」による新魔法システム実験の経過報告のため魔界に帰還したルシカ達十三級魔女三人娘は、魔王様への謁見前夜をそれぞれの自宅で過ごすためにひとまず別れる。エリート魔女として精鋭部隊に属していながら最下級魔女へ降格させられたスラガは、かつての同僚と再会し旧交を温める中で再就職先を紹介される。しかし、その旧友の背後には「言ノ葉の書」を巡って巨大な陰謀を企てる組織があった。

十三級魔女るるもと地上人・柴木耕太が巻き込まれた魔界のクーデター事件から一年後──。ルシカほか三人の新世代魔女が地上に降り立った。彼女たちは任務失敗続きで後がない最下級十三級の崖っぷち魔女だった。そんな彼女たちに課せられた魔界の未来を左右する使命とは!? ‥‥とか言いながら、ルシカは憧れの地上生活のことで頭がいっぱい。しかも、「呪文字」収集の舞台として選ばれたのはなんと地上の中学校！　落ちこぼれ魔女たちが、二級魔女となったるるもの監督のもとに「普通の女子中学生」を演じながら任務を果たしていく可愛すぎるドタバタコメディー（時々シリアス）。あの『弱虫ペダル』の渡辺航が描く本作も、いよいよ最終巻！
前巻で、魔界管理局第六研究所所長ユマ博士による「言ノ葉の書」奪取計画の真の目的が魔王暗殺であることが明らかにされた。それは、ルシカ達から奪った「言ノ葉の書」で5千年前の過去に戻り、魔王としての絶対的な力を得る前の少女を殺害して歴史を改変する計画であった。ユマ博士を追って過去に飛んだルシカは、驚くべき魔界の真実を知る。ルシカは魔王暗殺計画を阻止し、再び現代に戻ることができるのか！？