いつもどおりの朝――主人公、ヒイロを乗せたスクールバスが、突然赤い瞳を持つ少女に襲われた!!　ヒイロが目を覚ましたとき、そこは永久に封鎖されたはずの廃都市、“東京”!!　　ヒイロのほか、３人のクラスメイトたちが生き残るが、“東京”には、ある特徴を持った少年少女が集められており、新たなルールが設けられていた…。圧倒的なスピード感でおくる、サバイバル・サイキック・アクション!!

１０年前に東京を襲った史上最悪の強毒性ウィルス「パンドラ・ウィルス」。そのわずかな生き残りである子供たちには、恐るべき遺伝子が眠らされていた――。互いの遺伝子を奪い合い、『更新』をしなければ体が朽ち果て、やがては死に至るという。残酷な運命にヒイロはどう立ち向かうのか!?

異常な能力を秘めた「パンドラウイルスキャリア」の少年少女たち――。キャリアの少年少女は次々と己の「コード」に目覚めていく。しかし、それは同時に『更新』という非情な運命の始まりを意味していた。迫り来る「死」を目の当たりにしながら、ヒイロは連れ去られた幼馴染み、アンナの奪回に向かう――！

アンナ奪回に向かったヒイロは、もっとも数多く更新した男、和泉千秋との一騎打ちに臨んだ。最強の男を前にヒイロは、諸刃の刃である己のコード、「マルチコード」を開放する。遺伝子の更新なくば死――。死を賭して闘うヒイロに対して、タカシが取った行動は…！