士郎正宗の『攻殻機動隊１．５』のつづきの世界。草薙素子が姿を消した後の公安９課を描いた『攻殻機動隊』最新作！　
東北のトワダで、草薙素子の汚染された義体が見つかったという報告を受けて、捜査に向かったトグサと霊能局からやってきた新メンバーのツナギ。事件と関連のある宗教団体「アテルイ」に潜入するが、サイトーの宿敵ともいえる強敵に出くわす。一方、沖縄でも素子の影があったということで、バトー、アズマ、イシカワが捜査にあたるが、中国マフィアの襲撃を受ける。北と南の事件が線となり、関係者の陰謀が浮かび上がってくる。公安９課は事件が明るみになる前に食い止められるのか!?

士郎正宗の『攻殻機動隊１．５』のつづきの世界。草薙素子が姿を消した後の公安９課を描いた『攻殻機動隊』最新作第２巻！　

公安９課から姿を消した草薙素子の義体が見つかった報告を受けて、捜査を始めたトグサと新人のツナギ。宗教団体「アテルイ」を調査中に高出力の義体部隊の襲撃を受けて、ツナギが負傷する。さらにツナギは、サイトーも警戒する最強の狩人「シロクマ」に連れ去られてしまう。一方、義体メーカー「オオサキ工業」を捜査中のバトーとイシカワは、事件と関連がある階上承を見張っていた。しかし中国マフィアから逃げるために、階上が仕掛けた攻撃によりイシカワが乗っ取られてしまい、バトーと戦うハメになる！！

トグサの前には「シロクマ」が、バトーの前には「イシカワ」が敵として現る！！

士郎正宗の『攻殻機動隊１．５』のつづきの世界。草薙素子が姿を消した後の公安９課を描いた『攻殻機動隊』最新作第３巻！　

公安9課を去った草薙素子の義体が東北のトワダで発見されたため、捜査を開始したトグサと新人のツナギ。一方、沖縄近海でも草薙発見の報告が届いたため、暴力団組織に潜入しているイシカワとバトーが捜査にあたった。北と南の捜査が進むにつれ、”白熊”と呼ばれる暗殺者と階上承の2人が、新浜市新市長の神子元シンラ殺害を目論んでいるとわかった。地方に散らばっていた9課メンバーは神子元を守るために、最終決戦の地・ニューポートに集結した!!

新市長の生死によって、草薙素子から始まった一連の事件が完結する!!

トグサとツナギが追跡していたクルマに突然１台のトラックが突っ込んできた。
運転手の男は即死。電脳にアクセスすると「オレは戦士だ」と叫ぶ人物の残像とともに多くの子どもたちの姿が見えた。
これらが何を意味するかは不明だが、死因にアフリカに生息するブラックマンバの毒がかかわっていると判明。
トグサとツナギは「新婚旅行の休暇」で、サハラのオアシスと呼ばれる「サヘル経済特区」に向かうことに！！

民族対立の裏で大国の思惑がうごめく世界で最も熱い場所で、新たな任務が始まる！！

士郎正宗の『攻殻機動隊１．５』のつづきの世界。草薙素子が姿を消した後の公安９課を描いた『攻殻機動隊』最新作第２巻！　

公安９課から姿を消した草薙素子の義体が見つかった報告を受けて、捜査を始めたトグサと新人のツナギ。宗教団体「アテルイ」を調査中に高出力の義体部隊の襲撃を受けて、ツナギが負傷する。さらにツナギは、サイトーも警戒する最強の狩人「シロクマ」に連れ去られてしまう。一方、義体メーカー「オオサキ工業」を捜査中のバトーとイシカワは、事件と関連がある階上承を見張っていた。しかし中国マフィアから逃げるために、階上が仕掛けた攻撃によりイシカワが乗っ取られてしまい、バトーと戦うハメになる！！

トグサの前には「シロクマ」が、バトーの前には「イシカワ」が敵として現る！！